Marzo 2008

25/March/2008 at 10:47 pm (BioMinds)

Actualmente estoy trabajando con los estudiantes graduados José A. González y Marimar Hernández. Durante las pasadas semanas hemos estado trabajando en el diseño y preparación de nuevos contructos para poder determinar el efecto en el reportero de luiferasa de secuencias reguladoras que se encuentran en el 3′UTR de hIL-3.  Para esto clonamos la secuencia que nos interesa en un vector (plasmidio pcDNA) que contiene un promotor de citomegalovirus (CMV) que nos permite expresar en gen en células humanas como las HeLa y Jurkat cells. Además del promotor el plasmidio contiene un reportero de luciferasa, que es una enzima que produce bioluminicencia en algunos organismos, y así podemos medir la actividad de la encima utilizando un luminómetro. Antes de clonar la secuencia en el vector primero amplificamos esta secuencia por medio de la Reacción de polimerasa en cadena (PCR) que nos permite obtener muchas copias que contienen sitios de restricción que luego nos permite cortar a los extremos del fragmento de DNA para ligarlo con el plasmidio luego de cortarlo y linearizarlo con las mismas enzimas.  Luego de que tenemos el producto de la ligacion, que es nuestro constructo, transformamos células competentes (E. coli), con nuestro contructo y así mientras las células se van multiplicando el medio, que permite que solo crezcan las celulas que contienen el plasmidio , multiplican la cantidad del constructo que luego es extraido y purificado para ser utilizado en nuestros experimentos.  Dependiendo de la cantidad que se quiera del constructo se aplican distintas tecnicas para extraerlo.

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Visita a otros Bioblogs

25/March/2008 at 10:25 pm (BioMinds)

Mi experiencia viendo los Bioblogs de otros compañeros, además de informarme acerca de  las inventigaciones que se realizan en otros laboratorios, me ha ayudado a entender mejor la utilizad de un blog y sentirme mas confiada a la hora de trabajar en el mío. Sinceramente nunca antes habia trabajando en un blog y todo esto es nuevo para mi. Visite el blog Synthetic World: Plant Biotechnology que me llamo mucho la atención porque durante este semestre estoy tomando la clase de Botanica y en varios temas del curso han hablado de las orquídeas y gracias a este blog pude conocer acerca de otras investigaciones que se hacen con estas plantas. Me parece muy interesante la variedad de métodos que se emplean para cultivar orquídeas. Visite también el Blog de Marie Feliciano quien trabaja con plantas medicinales y me identifiqué mucho con ella al leer que esta trabajando con tecnicas de acepcia que son sumamente importantes para evitar contaminar los experimentos que realizamos en los laboratorios y asi tener mejores resultados en nuestros experimentos. Estas técnicas son utiles para cualquier experimento. Tambien pase a visitar el Blog de Jesse que nos cuenta que, al igual que yo, esta su primer experincia haciendo un blog y que encuentra aun bajo construcción lo cual entiendo porque a mi tambien me ha dado dificultades aunque ya por el momento me estoy entendiendo mejor como trabajar con el. Me llamo la atención que los primeros dos blog que vi trataban de investigaciones relacionadas a las plantas. Como ya les dije estoy tomando la clase de Botanica ahora y mientras mas aprendo sobre las plantas mas interesantes me parecen. No solo por los beneficios que nos dan sino porque aunque a veces parescan organismos simples es impresionante la gran diversidad que tiene el reino de las plantas. Me parece de suma importancia el investigar acerca de estos organismos ya que tienen gran importancia comercial y que producen, de manera natural, muchos quimicos que son utilizados en la biomedicina y que tienen muchas mas aplicaciones en la ciencia y la vida diaria. Gracias a los compañeros por compartir sus experiencias en el laboratorio y el conocimiento adquirido durante el proceso. Yo sigo enteniendome con el blog para poder compartir con ustedes mi experiencia en el laboratorio.

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Regulación post-transcripcional

13/March/2008 at 11:16 pm (BioMinds)

El flujo de informacion genética comienza con la transcripcion del DNA a RNA mensajero (mRNA) que luego es traducido a proteínas por el proceso de tranducción. Todos estos procesos son altamente regulados y toda regulación que ocurre luego de la transcripción se le conoce como regulación post-transcripcional que envuelve eventos que controlan la expresión genética como la modificación del extremo 5′ del mensajero (“capping”) y la poliadenilación. Dentro de las regiones no traducidas (UTR) del 3′ y 5′ del mensajero se encuentran elementos (secuencias) que estan envueltas en la regulación post-transcripcional.

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